Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf148G3X9R7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms