Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms