Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP8

Zc3h7b, Zinc finger CCCH type-containing 7B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h7bF8VPP8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h7bF8VPP8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms