Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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