Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

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Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Herc6F2Z461 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Herc6F2Z461 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms