Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms