Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930451I11RikE9Q9R3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms