Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms