Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K2

Gm17728, Predicted gene, 17728, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17728E9Q5K2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms