Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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