Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms