Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms