Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ryr1E9PZQ0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms