Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms