Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd2E9PZM4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms