Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms