Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgaE9PV24 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms