Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms