Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms