Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R1

Hfm1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hfm1D3Z4R1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Hfm1D3Z4R1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hfm1D3Z4R1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms