Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms