Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm3543D3Z235 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm3543D3Z235 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm3543D3Z235 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm3543D3Z235 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm3543D3Z235 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm3543D3Z235 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm3543D3Z235 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm3543D3Z235 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm3543D3Z235 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm3543D3Z235 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm3543D3Z235 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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