Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SafbD3YXK2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SafbD3YXK2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms