Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn24D3YXJ9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms