Protein–RNA interactions for Protein: C0HKD9

Mfap1b, Microfibrillar-associated protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap1bC0HKD9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mfap1bC0HKD9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mfap1bC0HKD9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mfap1bC0HKD9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mfap1bC0HKD9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mfap1bC0HKD9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mfap1bC0HKD9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mfap1bC0HKD9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mfap1bC0HKD9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mfap1bC0HKD9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mfap1bC0HKD9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mfap1bC0HKD9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mfap1bC0HKD9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mfap1bC0HKD9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mfap1bC0HKD9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mfap1bC0HKD9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mfap1bC0HKD9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms