Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms