Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmf1B9EKI3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms