Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms