Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm6133B2RY53 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms