Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms