Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5483B2RV77 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5483B2RV77 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms