Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Abcc8B2RUS7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms