Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms