Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt4B2RU40 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms