Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
JrklB2RRL2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
JrklB2RRL2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
JrklB2RRL2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
JrklB2RRL2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
JrklB2RRL2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
JrklB2RRL2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
JrklB2RRL2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
JrklB2RRL2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
JrklB2RRL2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
JrklB2RRL2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
JrklB2RRL2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrklB2RRL2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms