Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf518aB2RRF6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf518aB2RRF6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf518aB2RRF6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf518aB2RRF6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf518aB2RRF6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Znf518aB2RRF6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Znf518aB2RRF6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Znf518aB2RRF6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Znf518aB2RRF6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Znf518aB2RRF6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Znf518aB2RRF6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Znf518aB2RRF6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Znf518aB2RRF6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms