Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Uhrf1bp1B2KF50 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms