Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skint5A7XUY5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint5A7XUY5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms