Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms