Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AgrnA2ASQ1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms