Protein–RNA interactions for Protein: A2AQH1

Cerkl, Ceramide kinase-like, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CerklA2AQH1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CerklA2AQH1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms