Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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