Protein–RNA interactions for Protein: A2AJN7

Slc4a11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a11A2AJN7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc4a11A2AJN7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc4a11A2AJN7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc4a11A2AJN7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc4a11A2AJN7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a11A2AJN7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms