Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm12A2AJ77 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms