Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ckap5A2AGT5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms