Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp8nlA2ABX0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms