Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms