Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm6268A2A3U9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm6268A2A3U9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm6268A2A3U9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm6268A2A3U9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gm6268A2A3U9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gm6268A2A3U9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm6268A2A3U9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm6268A2A3U9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm6268A2A3U9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm6268A2A3U9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm6268A2A3U9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm6268A2A3U9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm6268A2A3U9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm6268A2A3U9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm6268A2A3U9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms