Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms