Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms